圖中表明了顯著性 pathway 之間的關(guān)系以及發(fā)現(xiàn)受實(shí)驗(yàn)影響的核心 Pathway。
信號(hào)通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建（Pathway-Network）介紹
根據(jù)所有差異基因同時(shí)參與的 Pathway 之間的相互調(diào)控關(guān)系構(gòu)建信號(hào)通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，從系統(tǒng)的角度研究各個(gè)信號(hào)通路間的信號(hào)傳導(dǎo)和調(diào)控過(guò)程，在多個(gè)顯著性 Pathway 中發(fā)現(xiàn)受實(shí)驗(yàn)影響的核心 Pathway, 以及實(shí)驗(yàn)影響的信號(hào)通路之間的調(diào)控機(jī)理。
KEGG 富集分析的結(jié)果或者感興趣的 KEGG 中的 pathway（pathway 個(gè)數(shù)大于 10）。
1、圖片文件（Network 圖），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打開(kāi)進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整；
3、文本文件：pathway 之間的關(guān)系以及每個(gè) pathway 對(duì)應(yīng)的 indegree，outdegree。
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